Padre MCGivney non fu mai troppo forte in salute e, oltre ad essere malato di tubercolosi, nel gennaio del 1890 venne improvvisamente colpito da una grave polmonite.
Varie terapie furono provate ma il suo declino continuò.
Il giovane si trovava in condizioni di salute sempre più precarie, al contrario dell'Ordine che aveva fondato, il quale si stava sviluppando verso una nuova vitalità.
Il 14 Agosto del 1890 Padre Michael J. McGivney morì all'età di 38 anni.
Nei suoi 13 brevi ma intensi anni da prete, la sua ispirazione Cristiana gli portò la lealtà e l'affetto di migliaia di persone che lo conoscevano come il Fondatore dei Cavalieri di Colombo.
Il giorno del suo funerale infatti venne contraccambiato dell’amore e del rispetto, attirando cattolici da tutto lo stato, più di 70 confratelli sacerdoti e leader civici.
Moltissime le Delegazioni provenienti da quasi tutti i 57 consigli dei Cavalieri di Colombo che erano stati istituiti nei primi otto anni dell'Ordine. Persone in lutto noleggiarono ogni carrozza disponibile entro miglia per la processione al terreno della famiglia McGivney a Waterbury.
Le spoglie sono attualmente conservate nella chiesa di Saint Mary a New Haven.